Die erste Geraer Johanniskirche stand am heutigen Johannisplatz in der westlichen Altstadt und ist bereits um 1200 als Pfarrkirche erwähnt. Die Kirche brannte 1450 während des sächsischen Bruderkriegs, von den Hussiten gebrandschatzt, erstmals ab. Sie wurde 1488 vom Naumburger Bischof bereits neu geweiht.