Unmittelbar neben der Burg, dem heutigen Schloss, entstand die Kollegiatstiftskirche, der heutige Dom St. Marien. Die mittelalterliche Kirche diente den Kapitularen als Gebetsraum und zur Feier der heiligen Messe. Durch einen Brand im Jahre 1470 wurden große Teile des Domes und das Archiv zerstört. In der Spätgotik erfolgte auf Initiative des Bischofs Johann VI. von Sahlhausen eine Erweiterung des Domes durch bedeutende Chorbauten im Osten und im Westen. Der Bischof wurde 1444 in Thammenhain, in der Nähe von Wurzen, geboren. In das Jahr 1508 fiel die Erweiterung des Ostchores, in dem sich heute die Kreuzigungsgruppe und der Altar befinden. Zwischen den südlichen Strebepfeilern entstanden niedrige Anbauten, so um 1515 ein Raum mit einem Kamin. Mit diesen spätgotischen Anbauten erhielt die Kirche ihre heutige Raumstruktur.